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上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院的前身“伯特利醫(yī)院”成立于1920年。1952年更名為上海第九人民醫(yī)院，1964年正式成為上海第二醫(yī)科大學(xué)附屬第九人民醫(yī)院(以下簡(jiǎn)稱“九院”)，2005年，上海第二醫(yī)科大學(xué)與上海交通大學(xué)正式合并，第九醫(yī)院更名為上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院（以下簡(jiǎn)稱 “九院”)。2014年11月，經(jīng)上海市人民政府同意，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院與上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第三人民醫(yī)院（原寶鋼醫(yī)院、三級(jí)綜合醫(yī)院）資源整合，南北醫(yī)院統(tǒng)一布局管理，上海第三人民醫(yī)院第（1）命名為“上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院(北院)”，第二冠名為“上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第三人民醫(yī)院”。2015年10月，上海市機(jī)構(gòu)編制委員會(huì)批復(fù)市教委同意上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第三人民醫(yī)院整建制并入上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院。

第九醫(yī)院是經(jīng)上海市衛(wèi)生局批準(zhǔn)登記的政府主辦的非營(yíng)利性三級(jí)甲等綜合性醫(yī)院。醫(yī)院總部位于上海市中心城區(qū)黃浦區(qū)(制造局路639號(hào))，北院/第三醫(yī)院位于上海北翼寶松區(qū)(漠河路280號(hào))。同時(shí)，在本市浦東新區(qū)，有第九醫(yī)院浦東分院(嚴(yán)鎮(zhèn)路166號(hào))、高科技口腔醫(yī)療美容門診(嚴(yán)橋路350號(hào))、徐匯區(qū)、虹梅口腔醫(yī)療美容門診(虹梅路3310號(hào))、靜安區(qū)、大沽口腔醫(yī)療美容門診(大沽路388號(hào))。醫(yī)院承擔(dān)本市基本醫(yī)療服務(wù)，主要從事急、危重、疑難疾病的治療，也是上海市120指定醫(yī)院、上海市口腔干部保健醫(yī)療指定醫(yī)院。

九院總占地面積109畝(南61畝，北48畝)，總建筑面積21畝.2萬(wàn)平方米(南部144萬(wàn)平方米).7萬(wàn)平方米，北部6.5萬(wàn)平方米)?？傭?yàn)證床位1800張(南部1000張，北部800張)，實(shí)際開放床位1819張(南部1019張，北部800張)。口腔綜合椅308張，臨床科室38個(gè)，醫(yī)療技術(shù)科室10個(gè)。全院?jiǎn)T工4301人。第九醫(yī)院現(xiàn)有中國(guó)工程院院士4人:著名整復(fù)外科專家張教授、口腔頜面外科專家邱教授、骨科專家戴教授、口腔頜面頭頸腫瘤專家張志愿教授。醫(yī)院現(xiàn)已成為一所學(xué)科特色鮮明、具備一定臨床科技創(chuàng)新核心競(jìng)爭(zhēng)力、國(guó)內(nèi)知名的三級(jí)甲等綜合性醫(yī)院。